当遇到拉卡拉刷卡机费率被暗调（未经通知的费率调整）时，能否追回多扣的手续费，这取决于多种因素。以下是清晰的分析和步骤，以及可能的追回方法：

1. 合同和协议条款：

1. 首先，用户需要查看与拉卡拉签订的合同或协议，了解费率调整的相关条款和规定。

2. 如果合同中有明确规定拉卡拉需要提前通知用户费率调整，并且拉卡拉没有履行通知义务，那么用户有权要求退还多扣的手续费。

2. 保留证据：

1. 用户需要保留相关证据，如交易记录、对账单等，以证明多扣的手续费是由于拉卡拉未通知费率调整而导致的。

2. 这些证据在后续的争议解决过程中将起到关键作用。

3. 与拉卡拉客服沟通：

1. 用户可以尝试联系拉卡拉的客服部门，详细说明情况并要求退还多扣的手续费。

2. 如果拉卡拉同意退还，那么问题将得到快速解决。

4. 投诉和举报：

1. 如果拉卡拉拒绝退还或沟通无果，用户可以采取更进一步的行动，包括向相关监管机构或行业协会进行投诉或举报。

2. 投诉渠道包括但不限于：中国人民银行（投诉专线12363）、中国支付清算协会、国家发展改革委员会（12381）等。

3. 同时，也可以选择使用对外公开的第三方投诉平台，如黑猫投诉等。

5. 法律途径：

1. 如果多扣的金额较大，用户可以考虑采取法律途径，如起诉拉卡拉要求退还多扣的手续费。

2. 在此过程中，用户需要准备好充分的证据，并咨询专业律师的意见。

6. 注意事项：

1. 每个支付公司的政策和处理方式可能有所不同，因此用户需要根据具体情况采取相应的行动。

2. 为了避免类似情况的发生，建议用户定期查看对账单和交易记录，及时发现问题并与支付公司进行沟通和处理。

7. 总结：

1. 当遇到拉卡拉刷卡机费率被暗调时，用户可以通过查看合同、保留证据、与客服沟通、投诉举报和法律途径等多种方式来维护自己的权益。

2. 重要的是要保持冷静并收集好相关证据，以便在后续的争议解决过程中能够有效地维护自己的权益。